長浜バイオ大の山本章嗣教授らとの共同研究（山本先生と吉森のdouble corresponding）の成果が、2009年11月にNature Cell Biology誌電子版に掲載されました。当研究室の藤田君が見つけたAtg4B変異体による未完成オートファゴソームの蓄積を手がかりに、林（西野）美都子さん（現阪大産研特任助教）が電子線トモグラフィーにより、オートファゴソームが小胞体の特殊化した部位で形成されることを示しました。長年の論争の的であるオートファゴソームの起源を示唆する成果として、日経産業新聞や共同通信で報道されました。また、Faculty of 1000 Biologyの"Must read" paperに選ばれました。成果発表のページへ

当研究室の学生だった山口さん（現在独立行政法人勤務）の学位研究の成果が、2009年11月にPLoS Pathogensに掲載されました。A群レンサ球菌を捕獲除去する巨大オートファゴソームの形成に、通常のオートファゴソーム形成には不要なsmall GTPase rab7が必須であることを示した研究です。成果発表のページへ

本研究室谷口奨励研究員の藤田君の研究成果が、2009年10月初めにJournal of Biological Chemistry誌電子版に掲載されました。Atg16L複合体の性状を分析すると同時に、クローン病患者で見られるAtg16LのT300A変異やそれが位置するWDリピートドメインの欠損が、通常のオートファジー及び病原菌に対するオートファジーに影響しないことを明らかにしました。

吉森研で学位を取りポスドクをしていた木村俊介君（現在理研）が吉森研で行ってCell Structure and Function誌に論文発表した研究（pubmedへ）が、平成２１年度の日本細胞生物学会論文賞を受賞しました。オートファゴソームが、リソソームと融合するためにダイニンモーター依存的に微小管上を移動することを示した研究です。

本研究室ポスドクの松永君の新規beclin1結合タンパク質に関する論文が、２００９年３月８日（英国時間）発行のNature Cell Biology電子版に掲載されると共に、３月９日付けの日本経済新聞、産経新聞、時事通信、共同通信、その他と３月２０日付けの朝日新聞で報道されました。この研究は、審良研を始め内外の大勢の人の協力のもとに行われました。成果発表のページへ

２００９年１月２３日に行われた微生物病研究所業績発表会で、吉森研代表の松永君の発表が優秀賞を獲得しました。本発表会では、各研究室の若手が研究発表し、研究所のポスドク以上の全スタッフの投票で優秀賞２名と最優秀賞１名が選ばれます。優秀賞受賞者には副賞として５０万円が与えられます（写真）。

文科省科研費の新しい種目、新学術領域研究（研究領域提案型）に「細胞内ロジスティクス：病態の理解に向けた細胞内物流システムの融合研究」（領域代表：吉森）が採択されました。平成２０年度から５年間、７人の計画班員と２０人以上の公募班員でメントラ研究の新たな発展を目指します。

文科省のグローバルCOEプログラムに大阪大学の「オルガネラネットワーク医学創成プログラム」が採択され、２００８年度から５年間実施されます。吉森がコアメンバーとして参加します。

大阪大学免疫フロンティア研究センター・審良静男センター長の研究室と我々との共同研究の成果がnature誌に掲載されました（成果発表のページ）。オートファジーが炎症性サイトカインの過剰産生を抑制していることを示す画期的な内容です。藤田特別研究員が、筆頭著者と同等の貢献をしました。

2007 年5月28～30日に福岡で行われた日本細胞生物学会で、吉森研ポスドクだった津田さんの2005年度CSF賞の授賞式が行われました。Cell Structure and Function誌に掲載された論文から年間で最優秀のものが選ばれ、賞金10万円が贈呈されます。津田さんは、吉森研で行った学位論文の仕事が高く評価されました。