課題名：血球の菌体認識および処理機構の解明に関する研究
2015年2月～2016年3月　研究代表者　

課題名：オートファジーの分子機構を標的とした治療戦略の開発
2012年10月～2013年9月　研究代表者　

課題名：オートファジーにおける膜の起源：オルガネラバイオジェネシスの解明
2011〜2013年度　研究代表者　

課題名：オートファジーの「定説」への挑戦
2011〜2012年度　研究代表者　

課題名：細胞内分解系ロジスティクスの疾患における役割と作動機構の解析
（領域名「細胞内ロジスティクス：病態の理解に向けた細胞内物流システムの融合研究」領域代表：吉森　保）
2008年度〜2012年度　研究代表者（計画研究＆総括班）