課題名：オートファジーによる生存戦略の分子基盤
2007〜2010年度　研究代表者　

課題名：病原体オートファジーの解析
2005〜2006年度　研究代表者　

課題名：細胞内自己消化システム・オートファジーによる生体防御
2007年度　研究代表者　

課題名：リソソームを中心とした輸送ネットワークの分子機構と機能
（領域名「メンブレントラフィック—分子機構から高次機能への展開—」、領域代表：大野博司教授、金沢大学）
2003〜2007年度　研究代表者（計画班）　

課題名：たんぱく質と膜が造る細胞内物流システム
（領域名「たんぱく質の構造・機能と発現メカニズム」・研究総括：大島泰郎教授、東京薬科大学）
2002年11月〜2007年10月　研究代表者